أن يكون برنامج الصيدلة الإكلينيكية بكلية الصيدلة جامعة القاهرة من أفضل البرامج على المستوى المحلى والإقليمي والعالمي المشهود له بالسبق في التطوير المستمر لنشر المعرفة والعلم وتحقيق التمايز لخدمة مؤسسات المجتمع المدني وبالأخص المؤسسات المعنية بالمنظومة الصحية العلاجية.
التميز في تقديم برنامج لتنمية صيادلة يمكنهم ممارسة مسار مهني ناجح في مجال الصيدلة الإكلينيكية. وتقديم خدمات صيدلية بمستوى مهاري محترف، مع مراعاة أخلاقيات ممارسة المهنة، وتنمية رأس المال البشرى بالبرنامج خاصةً والكلية عامةً، والاهتمام باستخدام تطبيقات تكنولوجيا المعلومات، ومساهـمة أنشطة البرنامج في رفع كفاءة المنظومة العلاجية على المستوى القومي والمشاركة بفاعلية في خدمة المجتمع.
تتفق أهداف برنامج الصيدلة الإكلينيكية مع أهداف كلية الصيدلة الاستراتيجية المتمثلة في: